Boğaziçi Üniversitesi’nden mezun olduktan sonra, Yapı Kredi Yatırım, Vestel Bilişim ve Turkcell’de toplam 10 yıllık bir çalışma hayatı oldu. Bunlara paralel olarak Bilgi Üniversitesi’nde MBA’ini tamamladı. Hem girişimcilik ruhunun etkisi hem de ödeme hizmetlerine duyduğu ilgiyle kurumsal hayata veda ederek, 2008 yılında Mikro Ödeme’yi kurdu. 2012 yılında şirketin mobil ödeme alanında elde ettiği pazar liderliği ve pazara kazandırdığı yenilikçi ürünleri sayesinde Mediterra Capital’den yatırım aldı. 2014 Kasım ayında ise Mikro Ödeme AŞ, Wirecard AG’ye satıldı ve şirket ismi Wirecard Ödeme ve Elektronik Para Hizmetleri AŞ olarak değişti. Alper Akcan halen Wirecard Türkiye CEO’su olarak görev yapmaktadır. Wirecard dışındaki faaliyetlerinden bazıları; Lokum Games, Big Kazan ve Longi’dir. Akcan, aynı zamanda Ödeme ve Elektronik Para Derneği (ÖDED) yönetim kurulu üyesidir.